Há dispositivos ("jigs" para quem preferir...
) de várias marcas, por exemplo Wolfcraft, para isso mesmo. Não posso dar opinião sobre o que se consegue com eles porque nunca os usei.
O sistema mais tradicional, que possivelmente conhece, era com uns marcadores como os da fotografia (tirada do catálogo da Leroy-Merlin). O método era faze o furo numa das peças, meter lá um marcador do diâmetro correcto - com a ponta para fora, claro - ajustar o melhor possível uma peça à outra na posição desejada, e pressionar - a ponta deixava uma marca no sítio onde devia ser apontada a broca para fazer o furo na 2ª peça.
Há muitos anos que não uso esse sistema, não me lembro que rigor conseguia, penso que não era muito, mas sempre era melhor que nada.
O terceiro método, bastante falível mas que por vezes utilizo, é ajustar e fixar uma peça à outra na posição final e fazer a furação simultânea das duas peças. Claro está que se as peças se mexerem...
. Em geral, só uso este método em peças pequenas, ou quando quero reforçar uma colagem na qual não tenho confiança.
G.